原著論文

2025年

Centrophilic retrotransposon integration via CENH3 chromatin in Arabidopsis. *†Tsukahara S, †Bousios A, Perez-Roman E, Yamaguchi S, Leduque B, Nakano A, Naish M, Osakabe A, Toyoda A, Ito H, Edera A, Tominaga S, Juliarni, Kato K, Oda S, Inagaki S, Lorković Z, Nagaki K, Berger F, Kawabe A, Quadrana L, Henderson I, †Kakutani T.
Nature, 2025, 637:744-748. doi: 10.1038/s41586-024-08319-7.

2024年

Molecular and structural basis of the chromatin remodeling activity by Arabidopsis DDM1.
*†Osakabe A, * Takizawa Y, Horikoshi N, Hatazawa S, Negishi L, Sato S, Berger F, †Kakutani T, †Kurumizaka H.
Nat. Commun., 2024, 15:5187. doi: 10.1038/s41467-024-49465-w.
解説：クロマチンリモデリング因子DDM1とヌクレオソームとの複合体の立体構造を報告しました。さらに、他のリモデリング因子と共通するATP加水分解活性依存的なクロマチン構造変換に加え、DDM1はATP加水分解活性とは異なる経路でヌクレオソームの構造を変換する機能を有することを発見しました。
プレスリリース：https://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/10404/
論文のよもやま話：https://nondomain.org/archives/2370

H3K4me1 recruits DNA repair proteins in plants
*Quiroz D, Oya S, Lopez-Mateos D, Zhao K, Pierce A, Ortega L, Ali A, Carbonell-Bejerano P, Yarov-Yarovoy V, Suzuki S, Hayashi G, Osakabe A, †Monroe G. Plant Cell, 2024, 36:2410-2426. doi: 10.1093/plcell/koae089.

2023年

Histone variants shape chromatin states in Arabidopsis *Jamge B, *Lorković ZJ, *Axelsson E, Osakabe A, Shukla V, Yelagandula R, Akimcheva S, Kuehn AL, †Berger F.
Elife, 2023, 12:RP87714. doi: 10.7554/eLife.87714.
解説：ヒストン修飾やヒストンバリアントの分布に関して網羅的に解析し、シロイヌナズナではH2Aバリアントクロマチン修飾と非常に強い相関を示すことを報告した論文です。この論文の中で、クロマチンリモデリング因子DDM1がH2A.ZとH2A.Wの交換に関与し、DDM1の機能欠損でトランスポゾンが遺伝子のようなヒストン修飾を獲得することを発見しました。

Thiocholine-Mediated One-Pot Peptide Ligation and Desulfurization *Suzuki S, Nakajima Y, Kamo N, Osakabe A, Okamoto A, †Hayashi G, †Murakami H.
Molecules, 2023, 28:3655. doi: 10.3390/molecules28093655.

Elongation factor 1 is a component of the Arabidopsis RNA polymerase II elongation complex and associates with a subset of transcribed genes
*Markusch H, Michl-Holzinger P, Obermeyer S, Thorbecke C, Bruckmann A, Babl S, Längst G, Osakabe A, Berger F, †Grasser KD.
New Phytol., 2023, 238:113-124. doi: 10.1111/nph.18724.

2022年

Phosphorylation of the FACT histone chaperone subunit SPT16 affects chromatin at RNA polymerase II transcriptional start sites in Arabidopsis
*Michl-Holzinger P, Obermeyer S, Markusch H, Pfab A, Ettner A, Bruckmann A, Babl S, Längst G, Schwartz U, Tvardovskiy A, Jensen ON, Osakabe A, Berger F, †Grasser KD.
Nucleic Acids Res., 2022, 50:5014-5028. doi: 10.1093/nar/gkac293.

2021年

The chromatin remodeler DDM1 prevents transposon mobility through deposition of histone variant H2A.W
*Osakabe A, *Jamge B, Axelsson E, Montgomery SA, Akimcheva S, Kuehn AL, Pisupati R, Lorković ZJ, Yelagandula R, Kakutani T, †Berger F.
Nat. Cell Biol., 2021, 23:391-400. doi: 10.1038/s41556-021-00658-1.
解説：トランスポゾンの抑制的なエピゲノム修飾の維持に関わるシロイヌナズナ由来のクロマチンリモデリング因子DDM1が、H2A.Wバリアントを運搬してトランスポゾンを抑制する新規機構を報告しました。本論文は、同誌のNews & Views (https://www.nature.com/articles/s41556-021-00661-6) で取り上げられました。
https://www.nig.ac.jp/nig/ja/2021/04/research-highlights_ja/rh20210409.html
https://www.oeaw.ac.at/gmi/detail/news/lockdown-for-genome-parasites

A Synthetic Approach to Reconstruct the Evolutionary and Functional Innovations of the Plant Histone Variant H2A.W
Lei B, Capella M, Montgomery SA, Borg M, Osakabe A, Goiser M, Muhammad A, †Braun S, †Berger F.
Curr. Biol., 2021, 31:182-191.e5. doi: 10.1016/j.cub.2020.09.080.

2020年

The evolution and functional divergence of the histone H2B family in plants
*Jiang D, *Borg M, Lorković ZJ, Montgomery SA, Osakabe A, Yelagandula R, Axelsson E, †Berger F.
PLoS Genet., 2020, 16:e1008964. doi: 10.1371/journal.pgen.1008964.

Structural Studies of Overlapping Dinucleosomes in Solution
*Matsumoto A, †Sugiyama M, Li Z, Martel A, Porcar L, Inoue R, Kato D, Osakabe A, †Kurumizaka H, †Kono H.
Biophys. J., 2020, 118:2209-2219. doi: 10.1016/j.bpj.2019.12.010.

2018年

Transcription factor DUO1 generated by neo-functionalization is associated with evolution of sperm differentiation in plants
*Higo A, *Kawashima T, Borg M, Zhao M, López-Vidriero I, Sakayama H, Montgomery SA, Sekimoto H, Hackenberg D, Shimamura M, Nishiyama T, Sakakibara K, Tomita Y, Togawa T, Kunimoto K, Osakabe A, Suzuki Y, Yamato KT, Ishizaki K, Nishihama R, Kohchi T, Franco-Zorrilla JM, Twell D, †Berger F, †Araki T.
Nat. Commun., 2018, 9:5283. doi: 10.1038/s41467-018-07728-3.

Histone H2A variants confer specific properties to nucleosomes and impact on chromatin accessibility
*Osakabe A, *Lorkovic ZJ, Kobayashi W, Tachiwana H, Yelagandula R, Kurumizaka H, †Berger F. Nucleic Acids Res., 2018, 46:7675-7685. doi: 10.1093/nar/gky540.
解説：シロイヌナズナ由来の4種類全てのH2Aバリアントを含むヌクレオソームを試験管内で再構成し、H2A.Z特異的な不安定性やH2A.W特異的なクロマチン凝集作用など生化学的な性質を報告した論文です。また、ヌクレオソームに含まれる2つのH2A分子について、シロイヌナズナでは基本的に同じバリアントで構成されるという、動物とは異なる現象も発見しました。

Structural Diversity of Nucleosomes Characterized by Native Mass Spectrometry
*Saikusa K, Osakabe A, Kato D, Fuchigami S, Nagadoi A, Nishimura Y, Kurumizaka H, †Akashi S. Anal. Chem., 2018, 90:8217-8226. doi: 10.1021/acs.analchem.8b01649.

2017年

Synthetic Posttranslational Modifications: Chemical Catalyst-Driven Regioselective Histone Acylation of Native Chromatin
*Amamoto Y, *Aoi Y, Nagashima N, Suto H, Yoshidome D, Arimura Y, Osakabe A, Kato D, Kurumizaka H, †Kawashima SA, †Yamatsugu K, †Kanai M.
J. Am. Chem. Soc., 2017, 139:7568-7576. doi: 10.1021/jacs.7b02138.

Crystal structure of the overlapping dinucleosome composed of hexasome and octasome
*Kato D, *Osakabe A, Arimura Y, Mizukami Y, Horikoshi N, Saikusa K, Akashi S, Nishimura Y, Park SY, Nogami J, Maehara K, Ohkawa Y, Matsumoto A, Kono H, Inoue R, Sugiyama M, †Kurumizaka H.
Science, 2017, 356:205-208. doi: 10.1126/science.aak9867.
解説：クロマチンリモデリングの過程で隣接するヌクレオソームが衝突することで形成されると考えられていた”overlapping dinucleosome”の立体構造を報告した論文です。また、次世代シーケンスを用いた解析によってoverlapping dinucleosomeは転写開始点の下流で形成されうる新規のクロマチンユニットであることも発見しました。
プレスリリース：https://www.waseda.jp/top/news/50251
新着論文レビューによる解説：https://first.lifesciencedb.jp/archives/16431

Crystal Structure and Characterization of Novel Human Histone H3 Variants, H3.6, H3.7, and H3.8 *Taguchi H, Xie Y, Horikoshi N, Maehara K, Harada A, Nogami J, Sato K, Arimura Y, Osakabe A, Kujirai T, Iwasaki T, Semba Y, Tachibana T, Kimura H, †Ohkawa Y, †Kurumizaka H.
Biochemistry, 2017, 56:2184-2196. doi: 10.1021/acs.biochem.6b01098.

Influence of polynucleosome preparation methods on sedimentation velocity analysis of chromatin
*Kujirai T, Machida S, Osakabe A, †Kurumizaka H.
J. Biochem., 2017, 161:381-388. doi: 10.1093/jb/mvw081.

Polymorphism of apyrimidinic DNA structures in the nucleosome
*Osakabe A, *Arimura Y, Matsumoto S, Horikoshi N, Sugasawa K, †Kurumizaka H.
Sci. Rep., 2017, 7:41783. doi: 10.1038/srep41783.

Testis-Specific Histone Variant H3t Gene Is Essential for Entry into Spermatogenesis
*†Ueda J, *Harada A, *Urahama T, Machida S, Maehara K, Hada M, Makino Y, Nogami J, Horikoshi N, Osakabe A, Taguchi H, Tanaka H, Tachiwana H, Yao T, Yamada M, Iwamoto T, Isotani A, Ikawa M, Tachibana T, Okada Y, Kimura H, Ohkawa Y, Kurumizaka H, †Yamagata K.
Cell Rep., 2017, 18:593-600. doi: 10.1016/j.celrep.2016.12.065.

Synthetic chromatin acylation by artificial catalyst system.
*Ishiguro T, *Amamoto Y, *Tanabe K, *Liu J, Kajino H, Fujimura A, Aoi Y, Osakabe A, Horikoshi N, Kurumizaka H, Yamatsugu Y, †Kawashima SA, †Kanai M.
Chem, 2017, 2: 840-859. doi: 10.1016/j.chempr.2017.04.002.

2016年

Structure and function of human histone H3.Y nucleosome
*Kujirai T, Horikoshi N, Sato K, Maehara K, Machida S, Osakabe A, Kimura H, Ohkawa Y, †Kurumizaka H.
Nucleic Acids Res., 2016, 44:6127-41. doi: 10.1093/nar/gkw202.

C-terminal acidic domain of histone chaperone human NAP1 is an efficient binding assistant for histone H2A-H2B, but not H3-H4
*Ohtomo H, Akashi S, Moriwaki Y, Okuwaki M, Osakabe A, Nagata K, Kurumizaka H, †Nishimura Y.
Genes Cells, 2016, 21:252-63. doi: 10.1111/gtc.12339.

Crystal structure of the nucleosome containing ultraviolet light-induced cyclobutane pyrimidine dimer
*Horikoshi N, *Tachiwana H, *Kagawa W, Osakabe A, Matsumoto S, Iwai S, Sugasawa K, †Kurumizaka H.
Biochem. Biophys. Res. Commun., 2016, 471:117-22. doi: 10.1016/j.bbrc.2016.01.170.

Histone H3.5 forms an unstable nucleosome and accumulates around transcription start sites in human testis
*Urahama T, Harada A, Maehara K, Horikoshi N, Sato K, Sato Y, Shiraishi K, Sugino N, Osakabe A, Tachiwana H, Kagawa W, Kimura H, Ohkawa Y, †Kurumizaka H.
Epigenetics Chromatin, 2016, 9:2. doi: 10.1186/s13072-016-0051-y.

2015年

Structural basis of pyrimidine-pyrimidone (6-4) photoproduct recognition by UV-DDB in the nucleosome
*Osakabe A, Tachiwana H, Kagawa W, Horikoshi N, Matsumoto S, Hasegawa M, Matsumoto N, Toga T, Yamamoto J, Hanaoka F, Thomä NH, Sugasawa K, Iwai S, †Kurumizaka H. Sci. Rep., 2015, 5:16330. doi: 10.1038/srep16330.
解説：紫外線損傷の一つである(6-4)光産物を含むヌクレオソームの立体構造を報告した論文です。ヌクレオチド除去修復経路において損傷塩基を認識するタンパク質UV-DDBが損傷塩基そのものではなく、紫外線損傷によって形成されたふらふらなDNA部分を見つけ出すことを発見しました。
プレスリリース：https://www.waseda.jp/top/news/34770

Influence of DNA methylation on positioning and DNA flexibility of nucleosomes with pericentric satellite DNA
*Osakabe A, *Adachi F, Arimura Y, Maehara K, Ohkawa Y, †Kurumizaka H. Open Biol., 2015, 5:150128. doi: 10.1098/rsob.150128.
解説：重要なエピジェネティックマークであるメチル化シトシンを含むヌクレオソームの立体構造を報告した論文です。DNAのメチル化によって、ヌクレオソームの配置が変化しうることを発見しました。

Dynamic changes in CCAN organization through CENP-C during cell-cycle progression
*Nagpal H, Hori T, Furukawa A, Sugase K, Osakabe A, Kurumizaka H, †Fukagawa T. Mol. Biol. Cell, 2015, 26:3768-76. doi: 10.1091/mbc.E15-07-0531.

Stable complex formation of CENP-B with the CENP-A nucleosome
*Fujita R, *Otake K, Arimura Y, Horikoshi N, Miya Y, Shiga T, Osakabe A, Tachiwana H, Ohzeki J, Larionov V, †Masumoto H, †Kurumizaka H.
Nucleic Acids Res., 2015, 43:4909-22. doi: 10.1093/nar/gkv405.

Human tNASP promotes in vitro nucleosome assembly with histone H3.3
*Kato D, Osakabe A, Tachiwana H, Tanaka H, †Kurumizaka H.
Biochemistry, 2015, 54:1171-9. doi: 10.1021/bi501307g.

2014年

N-terminal phosphorylation of HP1α increases its nucleosome-binding specificity
*Nishibuchi G, Machida S, Osakabe A, Murakoshi H, Hiragami-Hamada K, Nakagawa R, Fischle W, Nishimura Y, Kurumizaka H, Tagami H, †Nakayama J.
Nucleic Acids Res., 2014, 42:12498-511. doi: 10.1093/nar/gku995.

DNA binding properties of the actin-related protein Arp8 and its role in DNA repair
*Osakabe A, Takahashi Y, Murakami H, Otawa K, Tachiwana H, Oma Y, Nishijima H, Shibahara KI, †Kurumizaka H, †Harata M.
PLoS One, 2014, 9:e108354. doi: 10.1371/journal.pone.0108354.

Nap1 stimulates homologous recombination by RAD51 and RAD54 in higher-ordered chromatin containing histone H1
*Machida S, *Takaku M, Ikura M, Sun J, Suzuki H, Kobayashi W, Kinomura A, Osakabe A, Tachiwana H, Horikoshi Y, Fukuto A, Matsuda R, Ura K, Tashiro S, Ikura T, †Kurumizaka H.
Sci. Rep., 2014, 4:4863. doi: 10.1038/srep04863.

Structure of human nucleosome containing the testis-specific histone variant TSH2B
*Urahama T, Horikoshi N, Osakabe A, Tachiwana H, †Kurumizaka H.
Acta Crystallogr. F Struct. Biol. Commun., 2014, 70:444-9. doi: 10.1107/S2053230X14004695.

The centromeric nucleosome-like CENP-T-W-S-X complex induces positive supercoils into DNA
*Takeuchi K, Nishino T, Mayanagi K, Horikoshi N, Osakabe A, Tachiwana H, Hori T, Kurumizaka H, †Fukagawa T.
Nucleic Acids Res., 2014, 42:1644-55. doi: 10.1093/nar/gkt1124.

2013年

Structural basis of a nucleosome containing histone H2A.B/H2A.Bbd that transiently associates with reorganized chromatin
*Arimura Y, †Kimura H, Oda T, Sato K, Osakabe A, Tachiwana H, Sato Y, Kinugasa Y, Ikura T, Sugiyama M, Sato M, †Kurumizaka H.
Sci. Rep., 2013, 3:3510. doi: 10.1038/srep03510.

Structural polymorphism in the L1 loop regions of human H2A.Z.1 and H2A.Z.2
*Horikoshi N, Sato K, Shimada K, Arimura Y, Osakabe A, Tachiwana H, Hayashi-Takanaka Y, Iwasaki W, Kagawa W, Harata M, Kimura H, †Kurumizaka H.
Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr., 2013, 69:2431-9. doi: 10.1107/S090744491302252X.

Contribution of histone N-terminal tails to the structure and stability of nucleosomes
*Iwasaki W, Miya Y, Horikoshi N, Osakabe A, Taguchi H, Tachiwana H, Shibata T, Kagawa W, †Kurumizaka H.
FEBS Open Bio., 2013, 3:363-9. doi: 10.1016/j.fob.2013.08.007.

Vertebrate Spt2 is a novel nucleolar histone chaperone that assists in ribosomal DNA transcription
*Osakabe A, Tachiwana H, Takaku M, Hori T, Obuse C, Kimura H, †Fukagawa T, †Kurumizaka H.
J. Cell Sci., 2013, 126:1323-32. doi: 10.1242/jcs.112623.
解説：新規のヒストン結合因子として同定したSpt2は核小体で機能するヒストンシャペロンであることを報告した論文です。この論文では、Spt2をノックアウトしたニワトリDT40細胞を樹立し、RNA polymerase Iによる転写活性が下がることをRun-onアッセイによって発見しました。国立遺伝学研究所の深川竜郎研究室 (当時) で遺伝学と細胞生物学を勉強することができた、大変思い入れの強い論文となりました。

Nap1 regulates proper CENP-B binding to nucleosomes
*Tachiwana H, Miya Y, Shono N, Ohzeki J, Osakabe A, Otake K, Larionov V, Earnshaw WC, Kimura H, †Masumoto H, †Kurumizaka H.
Nucleic Acids Res., 2013, 41:2869-80. doi: 10.1093/nar/gks1464.

2012年

Histone chaperone activity of Fanconi anemia proteins, FANCD2 and FANCI, is required for DNA crosslink repair
*Sato K, *Ishiai M, Toda K, Furukoshi S, Osakabe A, Tachiwana H, Takizawa Y, Kagawa W, Kitao H, Dohmae N, Obuse C, Kimura H, †Takata M, †Kurumizaka H.
EMBO J., 2012, 31:3524-36. doi: 10.1038/emboj.2012.197.

2011年

Crystal structure of the human centromeric nucleosome containing CENP-A
*Tachiwana H, *Kagawa W, *Shiga T, Osakabe A, Miya Y, Saito K, Hayashi-Takanaka Y, Oda T, Sato M, Park SY, Kimura H, †Kurumizaka H.
Nature, 2011, 476:232-5. doi: 10.1038/nature10258.

Structures of human nucleosomes containing major histone H3 variants
*Tachiwana H, Osakabe A, Shiga T, Miya Y, Kimura H, Kagawa W, †Kurumizaka H.
Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr., 2011, 67:578-83. doi: 10.1107/S0907444911014818.
解説：ヒト由来のH3バリアント (H3.1, H3.2, およびH3.3) を含むヌクレオソームの構造を報告した論文です。この論文で、HeLa細胞から抽出したH3に含まれるH3バリアントを検証するために、Acid-Urea-Triton (AUT) PAGEによる解析を担当しました。当時 (現在でも) AUT-PAGEを行える研究室がほとんど存在しなかったので、大阪大学木村宏研究室 (当時) に技術習得のために何度か訪問させていただきました。

Structural and biochemical analyses of the human PAD4 variant encoded by a functional haplotype gene
*Horikoshi N, Tachiwana H, Saito K, Osakabe A, Sato M, Yamada M, Akashi S, Nishimura Y, Kagawa W, †Kurumizaka H.
Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr., 2011, 67:112-8. doi: 10.1107/S0907444910051711.

2010年

Structural basis of instability of the nucleosome containing a testis-specific histone variant, human H3T
*Tachiwana H, Kagawa W, Osakabe A, Kawaguchi K, Shiga T, Hayashi-Takanaka Y, Kimura H, †Kurumizaka H.
Proc. Natl. Acad. Sci. U S A, 2010, 107:10454-9. doi: 10.1073/pnas.1003064107.

Nucleosome formation activity of human somatic nuclear autoantigenic sperm protein (sNASP)
*Osakabe A, Tachiwana H, Matsunaga T, Shiga T, Nozawa RS, Obuse C, †Kurumizaka H.
J. Biol. Chem., 2010, 285:11913-21. doi: 10.1074/jbc.M109.083238.
解説：ヒストンシャペロンNASPによるヌクレオソーム形成能に、ヒストンH3バリアント特異性があることを報告した論文です。

2008年

Nucleosome formation with the testis-specific histone H3 variant, H3t, by human nucleosome assembly proteins in vitro
*Tachiwana H, *Osakabe A, Kimura H, †Kurumizaka H.
Nucleic Acids Res., 2008, 36:2208-18. doi: 10.1093/nar/gkn060.
解説：ヒトの精巣で特異的に発現するH3バリアントH3tをリコンビナントとして発現・精製し、ヌクレオソームを試験管内で再構成した初めての論文です。ヒストンシャペロンNap1およびNap2によるH3tヌクレオソーム形成能の違いを発見しました。

＜総説・著書＞　†責任著者

2023年

Histone renegades: Unusual H2A histone variants in plants and animals
†Osakabe A & †Molaro A.
Semin. Cell Dev. Biol., 2023, 135:35-42. doi: 10.1016/j.semcdb.2022.05.001.

2017年

Genome-Wide Profiling of Histone Modifications and Histone Variants in Arabidopsis thaliana and Marchantia polymorpha
Yelagandula R, Osakabe A, Axelsson E, Berger F, †Kawashima T.
Methods Mol. Biol., 2017, 1610:93-106. doi: 10.1007/978-1-4939-7003-2_7.

プレプリント

2024年

Single residue changes to the histone core catalyze neofunctionalization and impose fitness trade-offs
†*Harvey ZH, Stevens KM, Kok JY, Osakabe A, Liu Y, †Warnecke T, †Berger F.
bioRxiv, doi: 10.1101/2024.05.10.593535

2022年

The histone variant H2A.W cooperates with chromatin modifications and linker histone H1 to maintain transcriptional silencing of transposons in Arabidopsis
*Bourguet P, *Yelagandula R, To TK, Osakabe A, Alishe A, Lu RJH, Kakutani T, †Chen PY, †Berger F.
bioRxiv, doi: 10.1101/2022.05.31.493688

日本語総説

越阪部晃永、Frédéric Berger 、2021、Current Topics: クロマチンリモデリング因子DDM1によるパラサイトDNAの鎮静化機構、実験医学9月号　空間トランスクリプトーム、羊土社、39巻、2242-2245頁、ISBN: 978-4-7581-2547-5

胡桃坂仁志、加藤大貴、越阪部晃永、2017、Current Topics: オーバーラッピングダイヌクレオソームの立体構造と形成機構、実験医学9月号　知られざるp53の肖像、羊土社、35巻、2381-2384頁、ISBN: 978-4-7581-0167-7

越阪部晃永、胡桃坂仁志、2015、クロマチン構造基盤の多様性−古くて新しい動的構造体の不思議−、ナノ学会会報、ナノ学会、13巻、93-97頁、ISBN: 1347-8028

有村泰宏、越阪部晃永、2014、ヒストンバリアントと発がん、実験医学8月号　エピゲノムの本質はヒストンバリアントにあった！生命の暗号を秘めた核内のパズル、羊土社、32巻、2097-2104頁、ISBN: 978-4-7581-0130-1

越阪部晃永、堀越直樹、胡桃坂仁志、2014、エピジェネティクスの構造基盤、実験医学増刊　構造生命科学で何がわかるのか，何ができるのか、羊土社、32巻、1674-1678頁、ISBN: 978-4-7581-0339-8

有村泰宏、越阪部晃永、胡桃坂仁志、2013、ヌクレオソーム、イラストで徹底理解するエピジェネティクスキーワード事典、羊土社、85-88頁、ISBN: 978-4-7581-2046-3

越阪部晃永、立和名博昭、胡桃坂仁志、2011、ゲル濾過クロマトグラフィー法、実験医学増刊　目的別で選べる核酸実験の原理とプロトコール、羊土社、97-101頁、ISBN: 978-4-7581-0180-6

日本語著書

越阪部晃永、胡桃坂仁志、2017、 ゲノムDNAを収納するクロマチンの構造基盤 (第三章) 、ナノバイオ・メディシン　細胞核内反応とゲノム編集、近代科学社、47-60頁、ISBN: 978-4-7649-5028-3